تولي جمارك دبي قضية التوطين أهمية بالغة ضمن خطتها الاستراتيجية، وذلك مواكبة للتوجهات والمبادرات الحكومية بهذا الشأن. وتعمل الدائرة على استقطاب الموارد البشرية المواطنة عالية الكفاءة في كافة الوظائف ومجالات العمل الجمركي، لتحقيق مستهدفات خطة التوطين التي يجري تطويرها بشكل مستمر.

تستمر مبادرة التوطين التي تبنتها جمارك دبي في التطور لتلبية الاحتياجات المتزايدة للدائرة والقوى العاملة المواطنة، حيث لم يعد التركيز يقتصر فقط على توظيف الكوادر الإماراتية بل أيضاً تطويرهم وصقل مهاراتهم من خلال دورات تدريبية متنوعة، وإعدادهم كأخصائيين قادرين على أداء مهامهم بأعلى المستويات.​